Основатель Макариевской премии — митрополит Макарий (Булгаков; 1816–1882), выдающийся иерарх Русской Православной Церкви, крупный общественный деятель, историк, богослов, автор монументальных трудов «История Русской Церкви» и «Православно-догматическое богословие», ординарный академик Императорской академии наук, почетный член российских духовных академий, лауреат полной Демидовской премии.
В 1867 г. владыка Макарий, в то время занимавший Харьковскую кафедру, пожертвовал государству полученные им от издания своих сочинений 120 000 руб., чтобы на проценты с этой суммы ежегодно присуждались премии его имени за лучшие труды по богословским и светским наукам поочередно Святейшим Синодом и Императорской академией наук. 8 мая 1867 г. император Александр II утвердил «Главные положения для присуждения премии архиепископа Харьковского и Ахтырского Макария за лучшие сочинения по наукам светским», а в 1868 г. — «Положение о конкурсах на премии Преосвященного Макария, архиепископа Харьковского и Ахтырского, за сочинения по предметам богословским и вообще духовного звания». Размер полной премии был внушительным — 1500 руб., неполная премия составляла 1000 руб. За один конкурс не присуждалось более двух полных и трех неполных премий. Вручение наград должно было начаться после смерти ее основателя. Однако еще при его жизни, начиная с 1869 г., Святейший Синод с разрешения владыки стал присуждать ежегодную премию за лучшие учебники и учебные пособия по предметам, преподаваемым в духовных семинариях и училищах.
Первое присуждение за лучшие труды по богословским наукам состоялось в 1884 г., по светским — в 1885 г. Святейшим Синодом были награждены С.А. Белокуров (1894), А.П. Голубцов (1894), Н.Н. Глубоковский (1892), А.П. Доброклонский (1886, 1892), иеромон. Никон (Рождественский, 1888) и мн. др. Среди удостоенных премией Императорской академией наук были историки Д.Ф. Масловский (1887), А.Ф.Петрушевский (1903), Г.В.Форстен (1895), литературовед М.Н.Розанов (1907, 1913), географ-путешественник И.В. Мушкетов (1887, 1893), физики Э.Е. Лейст (1893, 1899, 1905), Н.А. Булгаков (1905), гидролог адмирал С.О.Макаров (1887, 1893), специалисты в сфере сельского хозяйства В.В. Докучаев (1885), А.С. Ермолов (1893), С.Н. Алфераки (1905) и мн. др. Последнее известное нам присуждение премий Святейшим Синодом состоялось в 1917 г., Императорской академией наук - в 1919 г.
В 1995 г. по инициативе Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II и при поддержке и деятельном участии соучредителей – мэра Москвы Ю.М. Лужкова и президента Российской академии наук академика Ю.С. Осипова Макариевская премия была возрождена (ее официальное название — Премия памяти митрополита Макария (Булгакова)) в области исторических знаний. Для проведения конкурса на соискание премии был основан Фонд по премиям памяти Митрополита Московского и Коломенского Макария (Булгакова).
В настоящее время высокими соучредителями Фонда являются Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл (с 2011 г.), президент Российской академии наук академик Г.Я. Красников (с 2022 г.) и мэр Москвы С.С. Собянин (с 2011 г.).
В соответствии с Уставом Фонда членами Комитета по премиям памяти митрополита Московского и Коломенского Макария являются соучредители - Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл, Мэр Москвы С.С. Собянин, Президент РАН академик РАН Г.Я. Красников, а также: председатель Фонда митрополит Ташкентский и Узбекистанский Викентий (Морарь); митрополит Липецкий и Задонский Арсений (Епифанов); ректор МГУ имени М.В. Ломоносова академик РАН В.А. Садовничий; председатель Экспертного совета Макариевского фонда по гуманитарным наукам, президент исторического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова академик РАН С.П. Карпов; председатель Экспертного совета по естественным наукам, вице-президент РАН, академик РАН В.Н. Пармон; руководитель ЦНЦ «Православная энциклопедия», ответственный редактор АНО «Большая Российская энциклопедия» С.Л. Кравец. До 2001 г. в состав Комитета входил епископ Верейский Евгений (Решетников), до 2007 г. — чл.-корр. РАН Я.Н. Щапов.
В 1995-1999 гг. исполнительным директором Фонда был д.и.н. В.В. Черепанов, в 2000-2003 гг. председателем Фонда являлся митрополит Воронежский и Липецкий Мефодий (Немцов), с 2003 г. организацию возглавил архиепископ Екатеринбургский и Верхотурский Викентий (Морарь); с 2011 митрополит Ташкентский и Узбекистанский). Со стороны Российской академии наук соучредителями и активными членами Комитета по премиям являлись Президенты РАН – академики Ю.С. Осипов (до 2013 г.), В.Е. Фортов (2013-2017 гг.), А.М. Сергеев (2017-2022 гг.).
До 2018 года премии вручались раз в два года. Первый конкурс был проведен в 1997 г. с присуждением 7 премий (1 первая, 2 вторых, 3 третьих, 1 молодежная) по 2 номинациям: «История Русской Православной Церкви» и «История Москвы». В 1999 г. количество премий по каждой номинации было сокращено до 5 (1 первая, 1 вторая, 2 третьих, 1 молодежная). Впоследствии вводились новые номинации: в 1999 г. — «История России» (5 премий), в 2005 г. — «История православных стран и народов» (5 премий), в 2007 г. — «Учебник или учебное пособие, представляющие вклад в науку в одной из существующих номинаций» (1 премия), в 2013 г. — «За достижения в популяризации научно-исторических знаний» (1 премия). В 2005 г. номинация «История Москвы» была расширена и получила наименование «История Москвы и историческое краеведение».
С 2018 года по решению учредителей присуждаются Макариевские премии в области естественных наук по трем номинациям:
1. Научные исследования в области естественных и точных наук, имеющие высокое общественное и гражданское значение (6 премий: первая премия – 1, вторая премия - 1, третья премия – 2, молодежная премия - 2).
2. Научные исследования в области рационального природопользования, экологии и охраны окружающей среды (6 премий).
3. Методы естественных и точных наук в изучении истории Церкви, христианских древностей и культурного наследия России и славянских стран, инновационные технологии, обеспечивающие высокое качество сохранения наследия (6 премий).
С 2023 года Макариевские премии в области гуманитарных наук присуждаются по семи номинациям:
1.История Православной Церкви (6 премий).
2.История России и русского зарубежья (6 премий).
3.История Москвы и историческое краеведение (6 премий).
4.История православных стран и народов (6 премий).
5.Учебник или учебное пособие, представляющие вклад в науку в одной из существующих номинаций (1 премия).
6.За достижения в популяризации научно-исторических знаний и за вклад в достоверное изложение истории (1 премия).
7.История христианской археологии и искусства (2 премии).
По предложению Экспертного совета и решению Комитета некоторые из премий могут не присуждаться.
Таким образом, в настоящее время конкурс научных трудов на соискание Макариевских премий проводится ежегодно поочередно: один год – по гуманитарным наукам, другой год – по естественным.
Представленные на конкурс труды рассматриваются экспертными советами Фонда по соответствующему направлению.
В экспертный совет по гуманитарным наукам входят известные специалисты-историки: светские и церковные ученые по различным историческим периодам и направлениям, специалисты по истории Москвы и истории России, представляющие Российскую академию наук, Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Московскую духовную академию, ЦНЦ «Православная энциклопедия», Православный Свято-Тихоновский гуманитарный университет. Первым председателем Экспертного совета был чл.-корр. РАН, д.и.н. Я.Н. Щапов (1995–1997), с 1999 г. его возглавляет академик РАН С.П. Карпов, президент исторического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова, лауреат Государственной и Ломоносовской премий. Ответственными секретарями были иеромонах Никон (Каширин; 1995-1999); член Союза журналистов России А.Л. Савельев (2001–2003); к.т.н., доцент Э.Ф. Гамаюнова (2003-2015); Е.Ю. Ковальская (2015-2017).
Члены Экспертного совета по гуманитарным наукам: д.и.н. А.Ю. Андреев (с 1999), магистр богословия прот. Валентин Асмус (с 1997), к. искусств., д.и.н. С.И. Баранова (с 2017), д.и.н., чл.-корр. РАН Л.А. Беляев (с 2015), д.и.н. Н.С. Борисов (с 2009), д.и.н. С.В. Девятов (с 2015), д.и.н. Ю.Н. Емельянов (с 1999), д.и.н. С.В. Журавлев (с 2021), к.и.н. Г.М. Запальский (с 2015), к.и.н. В.Ф. Козлов (с 1999), к.философ.н. С.Л. Кравец (с 1997), д.богословия, д.церковной истории архим. Макарий (Веретенников; с 1999), д.и.н. С.В. Мироненко (с 2007), к.и.н. свящ. Андрей Постернак (с 2005), чл.-корр. РАН, д.искусств. В.В. Седов (с 2011), к.и.н. А.А. Турилов (с 2005), чл.-корр. РАН, д.и.н. Б.Н. Флоря (1999, с 2003), д.филол.н. Е.М. Юхименко (с 2011). В работе совета также принимали участие: к.и.н. О.Ю. Васильева (1997), к.искусств. А.А. Преображенский (1997), к.богословия игум. Андроник (Трубачёв; 1997), к.богословия прот. Афанасий Гумеров (1997), д.и.н. Н.И. Цимбаев (1997), д.церковной истории прот. Владислав Цыпин (2001), к.и.н. С.А. Беляев (1997–2009), д.искусств. А.В. Рындина (1999–2009), д.и.н. Н.В. Синицына (1999–2013), д.и.н. В.А. Федоров (1999–2001), д.и.н. И.С. Чичуров (2005–2007), директор ГИМ А.И. Шкурко (1999–2009), чл.-корр. РАН, д.и.н. Я.Н. Щапов (1997–2007),. д.филол.н. Е.М. Верещагин (2011–2013), д.и.н. Н.Н. Лисовой (2009-2018). Решения Экспертного совета выносятся на утверждение Комитета по премиям памяти митрополита Московского и Коломенского Макария.
Экспертный совет по естественным наукам с 2018 г. возглавляет академик РАН В.Н. Пармон, вице-президент РАН. В состав Совета входят ведущие ученые различных научных областей – физики, химии, биологии, антропологии и археологии, геологии и др.: академик РАН А.П. Бужилова, академик РАН В.В. Зверев, академик РАН Ю.А. Золотов, академик РАН В.И. Осипов, академик РАН С.В. Кривовичев, член-корреспондент РАН А.В. Сиренов, академик РАН С.Н. Калмыков, академик РАН С.В. Алексеенко, член-корреспондент РАН В.В. Глупов.
Соискателей рекомендуют на конкурс Ученые советы институтов РАН, вузов, музеев, библиотек, правящие архиереи, академики и члены-корреспонденты РАН, лауреаты Макариевской премии.
Труды соискателей приходят не только из регионов Российской Федерации, но и из стран Ближнего и Дальнего зарубежья. В числе участников – лица всех возрастных категорий, в том числе пенсионеры и молодежь в возрасте до 37 лет. Данный конкурс отмечен весьма высоким качеством представленных работ, что делает работу экспертов особенно трудной, прослеживается стойкая тенденция участия в конкурсе молодого поколения ученых.
На сегодняшний день более 250 ученых России и зарубежья, наших современников, стали лауреатами Макариевской премии, что свидетельствует о всевозрастающем интересе научной общественности к конкурсу.
Торжественное вручение Макариевских премий традиционно проходит в конференц-зале Президиума Российской академии наук (Москва, Ленинский проспект, д. 14) под сопредседательством высоких учредителей. Лауреатам вручаются дипломы, медали лауреатов, денежные премии, номинантам — почетные благодарности, памятные медали.